在党的纪律检查工作中，遇到违纪后下落不明的党员时，如何进行妥善处理是一个复杂而重要的问题。这类情况涉及到党纪的严肃性与实际操作的灵活性之间的平衡。
首先，对于违纪后下落不明的党员，党组织应当立即采取措施，确保其违纪行为得到应有的调查和认定。这包括但不限于通过多种渠道寻找该党员的具体位置，了解其行踪，并尝试与其取得联系。在此过程中，必须严格遵守法律法规及党内规章制度，确保所有行动合法合规。
其次，在确认该党员确实存在违纪事实的前提下，党组织应根据其违纪情节轻重，按照党章及相关规定作出相应的处分决定。如果该党员拒绝接受组织调查或长期失联，则可考虑按照程序对其作出除名处理。这一过程需要充分的事实依据和严格的程序保障，以体现公正性和透明度。
同时，还需注意保护其他相关人员合法权益不受侵害。例如，在公开相关信息时应注意避免泄露个人隐私等敏感信息；对于涉及国家安全或其他特殊情况的案件，则需特别谨慎处理。
最后，建立健全长效机制也是解决此类问题的关键所在。一方面要加强党内监督体系建设，提高党员干部遵规守纪意识；另一方面也要完善相关法律制度设计，为处理类似情形提供更加明确规范的指导原则。
总之，在面对违纪后下落不明的党员时，既要坚持原则性又要注重灵活性，在依法依规前提下灵活应对各种复杂局面，从而更好地维护党的纪律尊严和社会公平正义。
